Члены школьного Клуба «Юннаты Первых» организуют для младших школьников путешествие по станциям, в процессе которого происходит получение новых экологических знаний через участие в экологических играх, мастер-классах. Каждый участник Экологического марафона заполняет личную Записную книжку Юного эколога, вклеивая в нее стикеры с терминами, определениями, схемами, тем самым закрепляя полученные на станциях знания. Записная книжка остается ему на память.
Участники перемещаются командами, которые к мероприятию готовят название, девиз, эмблему и ее краткую презентацию, в процессе посещения станций отвечают на вопросы, сообща выполняют задания игротехников, к завершению мероприятия выполняют итоговое задание – придумывают слоган «Экология …»